총장
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- 교수회
- 대학평의원회
- 교무위원회
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- 융합과학기술원
- 고등과학원
- 고등교육혁신원
- 윤리인권위원회
- 글로벌사회공헌원
- 총장실
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- 교학부총장
- 행정•대외부총장
- 의무부총장
- 미래캠퍼스부총장
- 국제캠퍼스부총장
- 연구부총장
조직도
부총장직속부서
- 미래융합교육개발원 연세머레이봉사단
- 미래인재개발원 연세AI데이터융합과학원
행정부서
- 원주교목실 원주기획처 원주교무처
- 입학홍보처 원주학생복지처
- 원주연구처 원주총무처
대학•대학원
- 글로벌창의융합대학 과학기술융합대학
- 소프트웨어디지털헬스케어융합대학 RC융합대학
- 글로벌엘리트학부 반도체시스템공학부
- 일반대학원
- 정경대학원
- 보건과학대학원
부속기관
- 원주대학교회 원주생활관 원주박물관 미래방송국
- 연세춘추(원주) 원주사회복지센터 건강관리센터 원주학술정보원
- 원주방사선안전관리센터 실험동물실 원주창업지원단
부속교육기관
- 국제교류원
- 미래평생교육원
- 원주교육연수원
기타기관
- 원주학생군사교육단 예비군연대
- 원주교수평의회 원주직원노동조합
부설연구기관
대학교부설연구소
- 빈곤문제국제개발연구원
- 바이오메디칼웰니스융합연구원
대학간연구소
- 근대한국학연구소
- 우주생명과학연구소
- 방사선융합연구소
대학부설연구소
- 기초과학연구소 에코문화디자인연구소
- 환경과학기술연구소 글로벌한국학연구소
원주산학협력단
SW중심대학사업단
원주대학혁신지원사업단
디지털헬스케어사업단
원주연세의료원
- 원주의과대학
- 원주간호대학
- 원주세브란스기독병원
